عبد العزيز سالم (1957 – 1958)
يُعتبر المهندس المصري عبد العزيز عبدالله سالم هو أول رئيس للاتحاد الإفريقي لكرة القدم وأحد المؤسسين الرئيسيين للاتحاد. قبل توليه هذه المنصب، كان يشغل وظيفة رئيس الاتحاد المصري لكرة القدم، كما يُنسب له الفضل في تأسيس بطولة كأس الأمم الإفريقية. وقد تم إطلاق اسم (كأس عبد العزيز سالم) على أول كأس للبطولة تكريماً لإنجازاته، حيث حقق منتخب غانا بطولة الكأس ثلاث مرات واحتفظ بها مدى الحياة.
محمد عبد العزيز مصطفى (1958 – 1968)
يُعتبر عبد العزيز مصطفى هو الرئيس الثاني للاتحاد الإفريقي لكرة القدم، حيث شغل هذا المنصب لمدة عشر سنوات. تولى مصطفى منصبه بعد عبد العزيز سالم خلال الجمعية العامة الثالثة للاتحاد الإفريقي في ستوكهولم، في ظل العلاقات المتوترة بين سالم ورئيس الاتحاد المصري لكرة القدم آنذاك. وجرى الاتفاق على استضافة الاجتماع التالي في مصر، وفي عام 1961، أعيد انتخاب مصطفى كرئيس للاتحاد الإفريقي لكرة القدم.
عبد الحليم محمد
يُعتبر الطبيب والسياسي السوداني عبد الحليم محمد هو أول رئيس لاتحاد كرة القدم السوداني وأحد مؤسسي الاتحاد الإفريقي لكرة القدم. تولى رئاسة الاتحاد الإفريقي مرتين، الأولى من عام 1968 إلى 1972، والثانية من عام 1987 إلى 1988. تقديراً لمساهماته، منح الاتحاد الإفريقي لقب الرئيس الفخري مدى الحياة. توفي عبد الحليم محمد عام 2009 عن عمر يناهز 99 عاماً.
يدنكاتشو تسيما (1972 – 1987)
شغل الإثيوبي يدنكاتشو تسيما منصب رئيس الاتحاد الإفريقي لكرة القدم لمدة خمسة عشر عاماً، ليكون بذلك الرئيس الرابع للاتحاد. كان تسيما واحداً من الأعضاء المؤثرين والمساهمين في تأسيس الاتحاد الإفريقي، وقد شغل أيضاً منصب نائب الرئيس من 1964 إلى 1972، وكان جزءاً من المؤتمر الرياضي الإفريقي ولجنة الأولمبياد الدولية. توفي تسيما في عام 1988، وبعد وفاته تم منحه لقب الرئيس الفخري.
عيسى حياتو (1988 – 2017)
يُعتبر عيسى حياتو، الرياضي الكاميروني، الرئيس السابق للاتحاد الإفريقي لكرة القدم. تولى مؤقتاً رئاسة الفيفا في عام 2015 بعد إيقاف جوزيف بلاتر على خلفية تحقيقات الفساد. بقي حياتو في رئاسة الفيفا لمدة عام حتى تم انتخاب جياني إنفانتينو رئيساً للاتحاد عام 2016. في عام 2017، فقد رئاسة الاتحاد الإفريقي لمصلحة أحمد أحمد، وفي نفس العام تم تعيينه رئيسًا للأكاديمية الوطنية لكرة القدم من قبل رئيس الكاميرون.
أحمد أحمد (2017 – 2021)
تولى السياسي والرياضي السابق من مدغشقر، أحمد أحمد، رئاسة الاتحاد الإفريقي لكرة القدم عام 2017 بعد فوزه على عيسى حياتو في الانتخابات التي أُقيمت في أديس أبابا. أسهم أحمد في العديد من المناصب الأخرى، بما في ذلك كونه عضواً في اللجنة التنفيذية للاتحاد الإفريقي ورئيس اتحاد مدغشقر مرتين، فضلاً عن شغله منصب وزير الرياضة في بلاده. وفي عام 2020، تم إيقافه من قِبَل الفيفا لمدة خمس سنوات بسبب انتهاكاته لقواعد الأخلاقيات وسوء السلوك المالي.
باتريس موتسيبي (2021 – حتى الآن)
باتريس موتسيبي هو رجل أعمال بارز من جنوب إفريقيا ويدير واحدة من أكبر شركات التعدين في القارة. يُعتبر الرئيس الحالي للاتحاد الإفريقي لكرة القدم، وفي عام 2003، قام بشراء نادي ماميلودي صن داونز، الذي يُعتبر من الأندية الكبرى في جنوب إفريقيا، مما شكل بداية شهرة موتسيبي في الساحة الرياضية في بلاده.